В 2012, 2013, 2014, 2015 годах вопросы оплаты труда работников образовательных учреждений решались в рамках выполнения Указов Президента РФ доведения средней заработной платы педагогических работников образовательных учреждений до уровня средней заработной платы в экономике Томской области, а в дошкольных учреждениях до уровня средней заработной платы по общеобразовательным учреждениям г.Томска, в дополнительном образовании – поэтапное повышение до 2018 года.
Основные средства направлены на увеличение стимулирующей части ФОТ и распределяются образовательными учреждениями в соответствии с локальными нормативными актами и Положениями. Однако Профсоюз образования настаивает на достойной базовой части оплаты труда.